La sonda FGFR4 Break Apart è stata progettata per identificare le traslocazioni/inversioni che coinvolgono la regione 5q35.2 e che ospita il gene FGFR4. Questi riarrangiamenti sono stati identificati in diversi tipi di tumori solidi come melanoma, carcinoma epatocellulare, tumore al polmone, al seno, allo stomaco ed altri. Tale gene codifica per una proteina coinvolta nella regolazione di diversi patway, tra cui la proliferazione cellulare, la differenziazione cellulare, la migrazione cellulare, il metabolismo lipidico, la biosintesi degli acidi biliari, il metabolismo della vitamina D, l’assorbimento del glucosio e l’omeostasi del fosfato. La sovraespressione di questa proteina determina l’attivazione della cascata di segnali che termina con il differenziamento cellulare.